李波太太于今年一月一日到警署报案后,警方将案件列作“失踪人士”,政府亦对此表示高度关注。行政长官梁振英主动联同署理保安局局长李家超会见传媒,强调根据“一国两制”的安排及基本法的规定,只有香港的执法人员有权在香港执法,不接受香港以外的执法人员在港执法。
尽管有传媒于1月9日报道,指李波的太太收到李波寄来的视频短片及书信,片中李波称今次返回内地纯属个人行为,只是有个人事务需要处理,与其他人无关。他批评有人拿这件事情来大做文章,令他和自己的家人受到很大的压力。翌日,反对派就李波事件发起游行抗议,有参与示威的激进组织更趁机叫嚣“港独”。
随后,警方多次与广东省公安厅就此事联络。1月18日,警方收到广东省公安厅覆函,指“经了解,李波现在内地”;1月29日,广东省公安厅函覆香港传媒有关铜锣湾书店股东李波的查询,指李波日前已去信香港警务处,说明“不是被绑架”,而是自愿返回内地接受调查,其在内地是自由和安全。